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よく聞かれる質問です。何十回聞かれたかわかりませんが、質問する側も質問される側も、その立場によって受け止め方が皆違います。
税務業務も監査業務も行っている私の考え方を整理してみます。
１、まず公認会計士業務と税理士業務は全く異なります。このことは理解してください。
２、「公認会計士と税理士はどこが違うのでしょうか？」の質問は、ともに数字を扱う業務であること、ある意味で会計の専門家として隣接の業務であることから、このような質問にあいます。
３、また、公認会計士は、その発生の過程からある時期まで、公認会計士の身分で税理士業務が行えたことから、公認会計士イコール税理士と誤認されたこと。
（税務行政の統一化の視点から、税務業務を行う公認会計士は「通知公認会計士制度」→「許可公認会計士制度」→　「公認会計士も税理士会に強制加入」と変遷して現在に至る）
４、現在でも、公認会計士資格取得者は、税理士会に登録すれば税理士業務を行えること。
５、従って、監査法人制度の無かった時代の公認会計士は、公認会計士の資格のままで税理士業務を行ったり、「渡辺公認会計士税理士事務所」のように両方の協会登録をして開業している公認会計士が大勢を占めていたこと。
６、現在は、公認会計士になるためには実務経験取得のため大部分の試験合格者が監査法人就職することになりますが、監査法人を退職すると税理士登録をして、「渡辺公認会計士税理士事務所」のような看板を掲げること、そして今でもそのような独立系の公認会計士兼税理士事務所が５０００件以上あること。

以上のようなことを理由として、公認会計士と税理士とが混同されていると思われます。
しかし「公認会計士と税理士はどこが違うのでしょうか？」と質問されるかたは、その混同をも背景にして「公認会計士と税理士のどちらに仕事を頼んだらいいのですか？」
という思いがあるはずです。